Dr.けーぴょんちゃんです。
自分の標的遺伝子の発現を評価する際に、House keeping geneの発現で補正します。
実験をされている方にとっては当然かもしれませんが、一応簡単にまとめておきます。
・House keeping geneは、細胞の基本的な機能を維持する役割を持ち、細胞の存在に不可欠であることから、組織特異的な遺伝子などの他の遺伝子に比べて、保存性が高く、進化が遅い傾向にあるゲノム上の領域。
・例としては、アクチン、GAPDHをよく使う。
・全ての細胞、全ての条件で一定の発現レベルを維持していると考えられている（個人的にはCell lineとPrimary Cellで大きく異なるのでいくつか例外はあると思います）。
参考サイト
ハウスキーピング遺伝子 Housekeeping gene |
要は、細胞の種や刺激条件が異なる細胞同士を補正する際のコントロール遺伝子、ということですね。
